Prof. Dr. Ahmet Çoker, karaciğer (hepatik), safra yolları (biliyer) ve pankreas hastalıklarının tanı, tedavi ve cerrahi müdahalesinde 40 yılı aşkın deneyime sahiptir. Ege Üniversitesi Organ Nakli Uygulama ve Araştırma Merkezi'nde Pankreas Nakli Program Direktörü olarak görev yapmıştır.
Bu alanda tedavi edilen başlıca hastalıklar şunlardır:
Laparoskopik ve açık cerrahi yöntemler, hastanın durumuna göre en uygun tedavi planı çerçevesinde uygulanmaktadır. Multidisipliner yaklaşımla gastroenteroloji, radyoloji ve onkoloji birimleriyle iş birliği içinde çalışılmaktadır.
Mayo Clinic (ABD) ve London University St. Bartholomew's Hospital (İngiltere) gibi dünyaca ünlü merkezlerde HPB cerrahisi alanında eğitim ve araştırma görevleri üstlenilmiştir. Avrupa-Afrika HPB Cerrahi Derneği Audit Komitesi Başkanlığı halen sürdürülmektedir.